MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	T	6	6	734	739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018662	ATA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018662	A	6	6	815	820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018662	TA	3	6	2202	2207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018662	TTAT	2	8	2269	2276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018662	ATC	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018662	ACA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018662	TCA	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018662	CAC	2	6	2504	2509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018662	TGT	2	6	2511	2516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018662	TG	3	6	2535	2540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018662	G	6	6	2540	2545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018662	T	6	6	2567	2572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018662	A	6	6	2585	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018662	GAAA	2	8	2591	2598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018662	C	7	7	2690	2696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_018662	AT	3	6	2725	2730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018662	A	9	9	2746	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018662	GCA	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018662	TCA	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018662	CGAC	2	8	3769	3776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018662	TCC	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018662	CAA	2	6	3849	3854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018662	AAAC	2	8	4126	4133	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018662	AGAC	2	8	4205	4212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018662	A	6	6	4218	4223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018662	CGC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018662	ATGA	2	8	4399	4406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018662	CAA	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018662	TGT	2	6	4592	4597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018662	TCAG	2	8	4622	4629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018662	CAGG	2	8	4678	4685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018662	A	6	6	4717	4722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018662	TAT	2	6	5761	5766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018662	AGTG	2	8	5774	5781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018662	TGC	2	6	5818	5823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018662	TTATG	2	10	5943	5952	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018662	CTG	2	6	5959	5964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018662	TA	3	6	5974	5979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018662	GC	3	6	6820	6825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018662	TTTG	2	8	6833	6840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018662	GCA	2	6	6890	6895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018662	GTG	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018662	GAT	2	6	6979	6984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018662	AAGG	2	8	6988	6995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018662	AG	3	6	7008	7013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018662	ACGCA	2	10	7071	7080	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018662	TGG	2	6	7084	7089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018662	AT	3	6	7290	7295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018662	TGG	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018662	TCC	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018662	T	6	6	7416	7421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018662	T	7	7	7432	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018662	GTT	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018662	AAT	2	6	8333	8338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018662	GGC	2	6	8357	8362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018662	CCG	2	6	8395	8400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018662	TGAT	2	8	8422	8429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018662	GA	3	6	8484	8489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018662	CGA	2	6	8516	8521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018662	CCAG	2	8	8598	8605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018662	ACA	2	6	8635	8640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018662	GGGCCG	2	12	8675	8686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018662	GAGG	2	8	8699	8706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018662	TGT	2	6	8764	8769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018662	CGC	2	6	8795	8800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018662	TCTG	2	8	8820	8827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018662	AATG	2	8	8863	8870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018662	AGT	2	6	8877	8882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018662	GGC	2	6	8935	8940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018662	GTT	2	6	9083	9088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018662	T	6	6	9087	9092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018662	T	6	6	9107	9112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018662	ATT	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018662	GAG	2	6	9168	9173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018662	TCT	2	6	10137	10142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018662	GCCA	2	8	10239	10246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018662	TCT	2	6	10282	10287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018662	CCT	2	6	10573	10578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018662	TAC	2	6	10611	10616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018662	T	6	6	10619	10624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018662	GAT	2	6	10651	10656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018662	ATA	2	6	10708	10713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018662	CGGG	2	8	10758	10765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018662	ATC	2	6	10810	10815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018662	GAA	2	6	11856	11861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018662	A	6	6	11899	11904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018662	GAA	2	6	11918	11923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018662	GAA	2	6	11946	11951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018662	ATAA	2	8	12004	12011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018662	AT	3	6	12022	12027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018662	AAAT	2	8	12051	12058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018662	CA	3	6	12093	12098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018662	AAC	2	6	12102	12107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018662	A	6	6	12159	12164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018662	A	7	7	12212	12218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018662	GTCTG	2	10	12524	12533	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018662	TCC	2	6	12536	12541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018662	TTTC	2	8	15415	15422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018662	TCCGCC	2	12	15464	15475	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018662	CTC	2	6	16318	16323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018662	TAT	2	6	16337	16342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018662	AAT	2	6	16350	16355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018662	CCT	2	6	16416	16421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018662	CT	3	6	16420	16425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018662	ATC	2	6	17023	17028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018662	CAC	2	6	22440	22445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018662	ACTC	2	8	22484	22491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018662	TGC	2	6	22499	22504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018662	ATG	2	6	22524	22529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018662	GCTG	2	8	22914	22921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018662	GTT	2	6	22952	22957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018662	GAT	2	6	23292	23297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018662	AAT	2	6	23298	23303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018662	AT	3	6	23340	23345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018662	AAC	2	6	23359	23364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018662	ACG	2	6	23431	23436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018662	TGA	2	6	23482	23487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018662	TCT	2	6	23540	23545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018662	ACAGGA	2	12	23612	23623	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018662	TATT	2	8	23657	23664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018662	CA	3	6	23706	23711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018662	TAAT	2	8	23815	23822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018662	TCA	2	6	23845	23850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018662	ATTT	2	8	24322	24329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018662	A	7	7	24337	24343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018662	GAATC	2	10	24359	24368	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018662	GCA	2	6	24399	24404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018662	ATCAC	2	10	24406	24415	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_018662	GTT	2	6	24448	24453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018662	TTA	3	9	24454	24462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018662	AAAT	2	8	24539	24546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018662	ATT	2	6	24555	24560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018662	GTG	2	6	24620	24625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018662	TGG	2	6	24630	24635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018662	ACC	2	6	24641	24646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018662	ATT	2	6	24679	24684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018662	CA	4	8	25275	25282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018662	TA	4	8	25343	25350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018662	CCT	2	6	25367	25372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018662	ATA	2	6	25394	25399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018662	TGA	2	6	25424	25429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018662	GAC	2	6	25445	25450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018662	GAT	2	6	25466	25471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018662	TAT	2	6	25514	25519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018662	TAA	2	6	26371	26376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018662	T	6	6	26380	26385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018662	ATC	2	6	26394	26399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018662	C	6	6	26399	26404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NC_018662	ACA	2	6	26426	26431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018662	TCA	2	6	26515	26520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018662	T	6	6	26524	26529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018662	GAT	2	6	26631	26636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018662	T	6	6	26636	26641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018662	AGA	2	6	26675	26680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018662	GCA	2	6	26698	26703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_018662	AT	3	6	26965	26970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018662	TCA	2	6	26971	26976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_018662	CAG	2	6	27529	27534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_018662	AAT	2	6	27624	27629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018662	AAGAG	2	10	27701	27710	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018662	C	6	6	27714	27719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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172	NC_018662	T	8	8	27761	27768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018662	GTT	2	6	27770	27775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_018662	A	6	6	27814	27819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_018662	AT	3	6	27923	27928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_018662	TAC	2	6	28246	28251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_018662	GCCT	2	8	28257	28264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
184	NC_018662	ATA	3	9	28380	28388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_018662	CGG	2	6	28489	28494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_018662	TTG	2	6	28591	28596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_018662	A	8	8	28747	28754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_018662	GTC	2	6	28806	28811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_018662	AT	3	6	36826	36831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018662	AGGA	2	8	36853	36860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018662	A	6	6	36890	36895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_018662	T	6	6	36921	36926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_018662	TCA	2	6	36939	36944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_018662	CTTT	2	8	37023	37030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_018662	AG	3	6	37033	37038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018662	CAC	2	6	37080	37085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_018662	ATTT	2	8	37114	37121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018662	TAT	2	6	37122	37127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018662	TAATA	2	10	37154	37163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018662	TAG	2	6	39759	39764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018662	TA	4	8	42202	42209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018662	TAA	2	6	42224	42229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018662	AT	3	6	42237	42242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_018662	ATA	2	6	42258	42263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018662	TG	3	6	42273	42278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018662	AT	3	6	42295	42300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018662	TGATT	2	10	42349	42358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_018662	TTC	2	6	57376	57381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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